Ne dešava se baš rijetko da se zbog neznanja ili nekih drugih razloga u pojedinim dijelovima Bosne i Hercegovine "zavijori" nepravilan oblik zastave BiH. Dva najčešća nepravilna oblika su:
* Zastava sa svijetlo plavom podlogom (lijevo na slici)
Ovaj oblik zastave je zvanični oblik zastave kojeg je izabrao visoki predstavnik, ali prije nego je uopće aneksiran član ustavnog zakona BiH o državnoj zastavi i grbu. Plava boja je potamnjena u odnosu na nijansu plave sa zastave UN-a na nijansu zastave EU-a, tako da se radi o nepravilnom obliku koji se javlja.
* Zastava s neispravnim položajem žutog trougla (desno na slici)
Ovaj oblik zastave se najčešće javlja kao nepravilan oblik zastave, a više puta je na dnevniku državne televizije po inicijativi OHR-a i Predsjedništva BiH građanima objašnjavano kakav je pravilan položaj žutog trougla na zastavi. Naime, on predstavlja geografski izgled Bosne i Hercegovine na političkim mapama, pa tako i sam trougao treba da bude postavljen na zastavi.