Igra jeste bugovita, a razlog tome je njena komplikovanost u skriptama, te problemi unutar razvojnog tima na početku.Ima tu svega, ali najmanje vezano za samu igru, pa je bezveze pričati o nama nebitnim stvarima(osim kada mladi stalkeri ne budu pri kraju Call of Pripyata, gdje će mnogo stvari biti jasnije

).
Eborg je u pravu glede banditskih zasjeda, posebno tamo gdje opisuje(betonski blokovi na kraju Garbage-a, uz koje je manja močvara) te grupica kerova.To jeste bug sa beskrajnim respawnom, ma koliko Purketa bolila ravničarska duša kad mu kažu da Stalker ima mana

.
Pronalaženje predmeta i opreme, ili čak pojedinih likova, je u 9 od 10 slučajeva sporedni zadatak, a sporedni zadaci služe da se igra produži i u nju što više uživi.Naravno, nekad je to zaista dosadno(barem meni), pa je preigravanje svakog božjeg side-questa stvar furke, jel..
Zaštitna oprema, medikit, zavoji
Odijelo za zaštitu od radijacije, narandžasto, može poslužiti, ali nije efikasno protiv metaka i ugriza mutanata, jer je i namijenjeno nenaoružanim naučnicima-ekolozima koji žive u Yantaru, a ne stalkerima koji ratuju međusobno. Tip: Narandžasto odijelo je dobro kao rezerva prilikom prelaska u level NPP(Nuklearka) i probijanja prema centru zla- komandi Monolith frakcije( čiji nevidljivi šefovi i uzrokuju lanac zla, mada to tumače opštom dobrobiti).
Ostala odijela su manje više jednako efikasna
što se tiče Shadow of Chernobyla, i tu manje razlike nisu toliko bitne, osim da se oštećeno odijelo ipak treba što prije zamijeniti.Jedina vidna razlika je između najslabijih- obične
bež jakne stalkera početnika sa malo kevlara, te
crne banditske kožne jakne, koje štite samo od pištoljske municije (zaključno sa heklerom je kraj priče o zaštiti).
Odijelo plaćenika(Mercenaries), plavi vrećasti jurišni prsluk sa pločama, je dosta teško.Sa njim u klasi je i pancir frakcije Freedom(
freedom suit, guardian of freedom suit).
Najbolje ga je uzeti samo do dolaska u Yantar, gdje je od Saharova najbolje kupiti
SEVA suit, crni kombinezon sa raspoređenim pločicama kevlara i zaštitnom maskom, te bocama za kisik.Mislim da košta 30.000 rublji kod Saharova.Nije previše skupo, a ja sam sa njim završio igru

.
Po meni je ipak najbolje odijelo
Bullat, koje savršeno kombinuje pokretljivost i otpornost, ali je užasno skupo(80-120.000).
Na kraju dolazi Egzoskeleton čija je jedina realna prednost to što možete nositi 80 umjesto 50 kg tereta, ali se ne može trčati.
Sva zaštita se može pojačati ili smanjiti djelovanjem određenih artefakata.
Sistem odijela i nadogradnje je do savršenstva razrađen u Call of Pripyatu, dok je u Clear Sky stvar pažnje i temeljitosti.Podaci o nadogradnji se nalaze na usb stickovima raznih sumnjivih likova, pa kad ih ubijete, potrebno je male plave ili bijele usb-ove odnijeti do tehničara u bazama kako bi napucali opremu.
U Clear Sky Complete 2009 čitav sistem je ukomponovan u poseban meni, pa nadogradnje vršite sami.